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貼壁細(xì)胞與懸浮細(xì)胞蛋白提取標(biāo)準(zhǔn)操作流程(SOP)及常見問題解決

更新時(shí)間:2026-03-25點(diǎn)擊次數(shù):53

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從培養(yǎng)細(xì)胞中提取總蛋白是最基礎(chǔ)的實(shí)驗(yàn)操作之一。但貼壁細(xì)胞與懸浮細(xì)胞因其生長狀態(tài)不同,操作細(xì)節(jié)上有所差異。本文為兩種細(xì)胞類型提供標(biāo)準(zhǔn)化操作流程(SOP),并匯總常見問題及解決方案。

一、通用準(zhǔn)備與要點(diǎn)

1. 全程低溫:所有操作在冰上或4℃條件下進(jìn)行,緩沖液預(yù)冷。

2. 抑制劑現(xiàn)加:裂解液使用前立即加入蛋白酶抑制劑和磷酸酶抑制劑(如需)。

3. 裂解液選擇:根據(jù)下游實(shí)驗(yàn)選擇(如RIPA用于總蛋白WB,NP-40用于IP)。

4. 裂解液用量參考

l 6孔板:120-150 μL/

l 12孔板:80-100 μL/

l 60 mm培養(yǎng)皿:300-400 μL

l 100 mm培養(yǎng)皿:500-800 μL

l 懸浮細(xì)胞(1×10?):500-800 μL

二、貼壁細(xì)胞總蛋白提取SOP

1. 清洗:棄培養(yǎng)液,用預(yù)冷PBS輕柔清洗細(xì)胞3次,徹-底吸干殘留液體。

2. 裂解:加入含抑制劑的裂解液,冰上孵育10-20分鐘。期間每5分鐘晃動(dòng)培養(yǎng)皿,使裂解液覆蓋均勻。

3. 收集:用預(yù)冷細(xì)胞刮快速刮下細(xì)胞,將裂解物轉(zhuǎn)移至預(yù)冷離心管。

4. 離心4℃12,000-14,000 rpm離心20分鐘。

5. 保存:取上清(即總蛋白),分裝,-80℃保存。

關(guān)鍵要點(diǎn)

l 避免胰酶消化:盡量用刮刀收集細(xì)胞,胰酶可能剪切膜蛋白并激活信號(hào)通路。

l 處理粘稠樣品:若樣品呈粘稠拉絲狀(核酸污染),可在裂解后加入DNase I10-20 U/mL,含2 mM Mg2?)冰上處理5分鐘,顯著降低粘度。

l 磷酸化蛋白:全程快速操作,從裂解到加入上樣緩沖液變性應(yīng)在30分鐘內(nèi)完成。

三、懸浮細(xì)胞總蛋白提取SOP

l 收集細(xì)胞:將細(xì)胞懸液轉(zhuǎn)移至離心管,室溫300-500×g離心5分鐘,棄上清。

l 清洗:用預(yù)冷PBS重懸細(xì)胞,相同條件離心洗滌2次,棄上清,留下緊實(shí)細(xì)胞沉淀。

l 裂解:按細(xì)胞量加入冰冷裂解液,用移液器輕柔但充分吹打10-15次,重懸沉淀。

l 孵育:冰上孵育10分鐘。對(duì)于難裂解細(xì)胞,可進(jìn)行短時(shí)超聲(1秒開/2秒停,共5-10次)。

l 離心4℃12,000-14,000×g離心10-15分鐘。

l 保存:取上清,BCA定量后,加入上樣緩沖液95℃變性5分鐘,分裝-80℃保存。

關(guān)鍵要點(diǎn)

l 紅細(xì)胞污染:若樣本為血液或含紅細(xì)胞,先用紅細(xì)胞裂解液(RBC lysis buffer 室溫處理1-2分鐘,離心棄上清后再進(jìn)入洗滌步驟。

l 細(xì)胞量少:可適當(dāng)減少裂解液體積以提高蛋白濃度。

l 顆粒物多:如漿細(xì)胞系,超聲步驟不可少,能顯著提高提取效率。

四、常見問題與解決方案

問題

可能原因

解決策略

蛋白濃度低

細(xì)胞量不足;裂解不充分;核酸干擾

增加起始細(xì)胞量;減少裂解液體積;加入超聲步驟;延長裂解時(shí)間至20分鐘

樣品粘稠(拉絲)

DNA釋放過多

加入DNase I10-20 U/mL)并短暫孵育;增加一次高速離心

磷酸化信號(hào)丟失

磷酸酶未被抑制;操作時(shí)間過長

確保磷酸酶抑制劑新鮮且添加足量;30分鐘內(nèi)完成裂解至變性

樣品起泡或降解

操作劇烈(渦旋);未保持低溫

輕柔吹打,避免渦旋;全程冰上操作

蛋白條帶異常

蛋白降解

檢查抑制劑是否失效;確保樣品保存于-80℃且避免反復(fù)凍融

五、總結(jié)

遵循標(biāo)準(zhǔn)化的SOP,根據(jù)細(xì)胞類型調(diào)整操作細(xì)節(jié),并警惕常見問題,能極大提高蛋白提取的成功率和重復(fù)性。對(duì)于新手而言,從貼壁細(xì)胞使用RIPA裂解液開始是較為穩(wěn)妥的選擇,逐步積累經(jīng)驗(yàn)后再優(yōu)化條件。

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